> Главная > Web ресурсы > База данных PP16-RUS

Что такое база данных PP16-RUS?

База данных PP16-RUS содержит данные по частотам ДНК-маркеров, используемых для ДНК-идентификации и в судебно-медицинской экспертизе (СМЭ), в популяциях России и сопредельных стран.
 

Зачем   нужны эти данные?

Представленные частоты могут быть референтными (для соответствующей популяции или этнической группы) для расчетов вероятностей идентификации для генетической экспертизы, включая идентификацию личности, тестирование отцовства и др.

Кроме того, данные могут использоваться для популяционно-генетических сравнительных исследований.
 

Какие маркеры представлены в базе?

В базе представлены данные по 15 STR-маркерам, входящим в набор Power Plex 16, выпускаемый компанией Promega:

CSFPO
D13S317
D16S539
D18S51
D21S11
D3S1358
D5S818
D7S820
D8S1179
FGA
PentaD
PentaE
TH01
TPOX
vWA
 

Каким российским и международным судебно-медицинским стандартам соответствуют представленные маркеры?

13 маркеров из 15 (все, кроме PentaD и PentaE) полностью закрывают набор STR-маркеров, обязательных при проведении генетической экспертизы в России согласно приказу МВД РФ № 70 от 10.2.2006 (в редакции от 21.05.2008).

Эти же 13 маркеров полностью закрывают стандарт CODIS (Combined DNA index), используемый в США.

7 маркеров (D3S1358, D8S1179, D18S51, D21S11, FGA, TH01, vWA) входят в состав европейского стандарта ESS (European Standard Set), используемого в Евросоюзе. Всего ESS включает 12 маркеров, 5 из которых не входят в набор PowerPlex 16 и не представлены в настоящей базе данных.

Эти же 7 маркеров полностью закрывают стандарт ESS, действоваший до 2009 г. и текущий стандарт ISSOL (Interpol Set of Standard Loci), применяемый Интерполом.

Подробнее о российских и международных судебно-медицинским стандартах смотрите в презентации (будет выложена в октябре).
 

Какие популяции представлены в базе данных?

В базе представлены данные по 17 популяциям России и сопредельных стран, а также суммарные данные по русским популяциям:

Население российских городов:

Белгород открыть файл с данными

Орел открыть файл с данными

Оренбург открыть файл с данными

Ярославль открыть файл с данными

Томск открыть файл с данными

Москва

Русские городские популяции суммарно открыть файл с данными

Внимание!
В файле данных по суммарным частотам аллелей в русских городских популяциях была обнаружена техническая ошибка. Частоты части аллелей локуса FGA были сдвинуты на одну строку. Файл с ошибкой удален и на его место загружен исправленный файл.
Просьба пользователям базы данных обновить свои файлы, скачав исправленный вариант.

Популяции этнических групп РФ:

Белорусы
Украинцы
Коми
Марийцы
Хакасы
Башкиры
Татары
Чуваши
Даргинцы
Лезгины
Аварцы

Данные в базу добавляются по мере их опубликования.
 

Кем создана база PP16-RUS?

База создана в результате совместной работы сотрудников Института медицинской генетики, Экспертно-криминалистического центра МВД РФ, Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН (Москва) института биохимии и генетики УНЦ РАН (Уфа) и компании Promega.

Создание базы явилось результатом выполнения гранта РФФИ № 07-04-01749 «Характеристика популяций и населения мегаполисов Российской Федерации по аллелям локусов, используемых для ДНК-идентификации в судебно-медицинской экспертизе».

Наборы PowerPlex 16 были предоставлены ООО «Бионем» - представителем компании Promega

 

Как ссылаться на базу PP16-RUS?

Ссылки в научных публикациях:

При использовании данных в научных публикациях обязательна ссылка на соответствующую статью.

По российским популяциям (Белгород, Орел, Оренбург, Ярославль, Томск):
Vadim A. Stepanov, Alexander V. Melnikov, Andrey Yu. Lash-Zavada, Vladimir N. Kharkov, Svetlana A. Borinskaya, Tatiana V. Tyazhelova, Olga V. Zhukova, Yuri V. Schneider, Irina N. Shil’nikova,Valery P. Puzyrev, Anna A. Rybakova, Nikolai K. Yankovsky. Genetic variability of 15 autosomal STR loci in Russian populations. Legal Medicine. 2010. V. 12. # 5. P. 256-258.

Для других популяций ссылки на статьи будут добавлены позже.

Кроме ссылки на статью желательна ссылка на веб-адрес базы данных:

http://www.medgenetics.ru/web-resources/pp16-rus/

При любом другом использовании данных достаточно ссылки на веб-адрес.

Публичное размещение базы данных на других ресурсах, в том числе электронных, запрещено.

Контакты

Степанов Вадим Анатольевич, академик РАН д.б.н., директор Томского НИМЦ
e-mail: vadim.stepanovmedgenetics.ru
тел. 8(3822)513334