Репликативный анализ ассоциаций генетических маркеров когнитивных признаков с болезнью Альцгеймера в Российской популяции
В 6 номере журнала Молекулярная биология опубликована статья Вадима Анатольевича Степанова с соавторами: В. А. Степанов, А. В. Бочарова , А. В. Марусин , Н. Г. Жукова, В. М. Алифирова , И. А. Жукова Репликативный анализ ассоциаций генетических маркеров когнитивных признаков с болезнью Альцгеймера в Российской популяции. Молекулярная биология, 2014, том 48, № 6, с. 952–962
Аннотация. В работе проведен репликативный анализ ассоциаций с болезнью Альцгеймера (БА) 15 генетических маркеров, связанных по результатам полногеномных исследований с когнитивными нарушениями. В российской популяции выявлена ассоциация БА с rs2616984 гена CSMD1 (OR = 1.50, 95% CI = 1.07–2.09, p-value = 0.018) и возможные взаимосвязи с заболеванием rs3131296 гена NOTCH4 (OR = 1.53, 95% CI = 0.98–2.39, p-value = 0.06) и rs2229741 гена NRIP1 (OR = 1.35, CI = 0.99–1.85, p-value = = 0.061). Обнаружены комбинации эпистатически взаимодействующих генов (CSMD1 и NRIP1; NOTCH4, CSMD1 и NRIP1; TLR4, CSMD1 и NRIP1) и сочетания их генотипов, значимо ассоциированные с БА и характеризующиеся наибольшей прогностической значимостью. Обсуждаются возможные молекулярные механизмы вовлечения изученных генов в патогенез заболевания. Биоинформационный анализ биологических процессов, молекулярных функций и белок-белковых взаимодействий генов БА показывает, что исследованные гены могут играть модулирующую или модифицирующую роль, соучаствуя в различных регуляторных и сигнальных путях, задействованных в процессах развития заболевания.
просмотров: 3160, опубликовано: 27.12.2014
