РУССКИЙ | ENGLISH | |
Forensic and population genetic characteristics of 62 X chromosome SNPs revealed by multiplex PCR and MALDI-TOF mass spectrometry genotyping in 4 North Eurasian population
В журнале Legal Medicine за 2016 год опубликована статья Степанова В.А. с соавторами Forensic and population genetic characteristics of 62 X chromosome SNPs revealed by multiplex PCR and MALDI-TOF mass spectrometry genotyping in 4 North Eurasian populations. Legal Medicine. 18 (2016) p. 66–71.
АННОТАЦИЯ
Х-хромосомные генетические маркеры широко используются в популяционной генетике и криминалистике. В данной работе представлены результаты анализа генетического разнообразия 62 Х-хромосомных SNP в четырех популяциях. В работе использовался метод мультиплексного генотипирования основанного на мультилокусной ПЦР и MALDI-TOF масс-спектрометрии. Проведена оценка информативности панели генетических маркеров (XSNPid) для криминалистики и популяционной генетики. Образцы ДНК исследованных индивидов принадлежат к популяционным выборками коренных народов Сибири (буряты и хакасы), Северной Азии (ханты) и средней Азии (казахи). Выборки хантов, хакасов и казахов показали относительно высокий уровень среднего генетического разнообразия (>0,45). Только восточно-сибирские буряты показали низкий уровень средней гетерозиготности (0,436). Оценка генетической структуры с помощью анализа молекулярной дисперсии (AMOVA) показала сравнительно низкий, но существенный уровень генетической дифференциации в группе 4 популяции (FST = 0.023, р = 0.0000). Панель XSNPid показала высокий уровень дискриминирующей способности для каждой популяции. Среднее значение вероятности дискриминации неродственных индивидов у женщин (PDf) для панели XSNPid варьирует от 0.99999999999999999999999982 у хакасов до 0.9999999999999999999999963 у бурят. Это же значение для мужчин (PDm) варьирует от 0.999999999999999792 до 0.999999999999999792. Разработанный мультиплексный набор, содержащий Х-хромосомные SNP может быть использован, как удобный инструмент для решения задач популяционной генетики, ДНК-идентификации и тестирования на родство.
просмотров: 2771, опубликовано: 09.02.2016
|
|
Copyright © НИИ Медицинской Генетики |
|