журнал Генетика 2019, том 55, №10
В десятом выпуске журнала "Генетика" опубликованы статьи сотрудников лаборатории цитогенетики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ.
Саженова Е.А., Лебедев И.Н. Эпигенетический мозаицизм при болезнях геномного импринтинга. // Генетика, 2019, том 55, № 10, с. 1137–1150.
Дифференциальный характер генной экспрессии в развитии организма поддерживается сложными регуляторными эпигенетическими механизмами, обеспечивающими формирование различных специализированных типов клеток. В результате многоклеточный организм представляет собой мозаику клеток с различающимися эпигенетическими характеристиками. Высоко вероятно, что выход за границы нормальной эпигенетической вариабельности может обусловливать возникновение патологичных мозаичных состояний, при которых одна часть клеточной популяции обладает нормальным эпигенотипом, а другая несет измененную эпигенетическую информацию. В настоящем обзоре на примере явления геномного импринтинга как классического эпигенетического феномена впервые обобщены данные о распространенности эпигенетического мозаицизма, механизмов его возникновения и роли в этиологии наследственных болезней, обусловленных дисфункцией импринтированных локусов генома.
Никитина Т.В., Кашеварова А.А., Лебедев И.Н. Хромосомная нестабильность и коррекция кариотипа в индуцированных плюрипотентных стволовых клетках человека. // Генетика, 2019, том 55, № 10, с. 1122–1136
Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки (ИПСК) человека являются многообещающим источником клеток для регенеративной медицины, изучения процессов патогенеза различных заболеваний, скрининга фармакологических препаратов и других клинических и фундаментальных исследований. Однако для применения ИПСК необходимо сохранение генетической стабильности клеток при репрограммировании, длительном культивировании и направленной дифференцировке. Крупные хромосомные аберрации наиболее негативно влияют на качество ИПСК, поэтому обзор в основном сосредоточен на анализе хромосомных аномалий, в том числе так называемых рекуррентных (повторяющихся) анеуплоидий, анализируются источники их возникновения, влияние процессов репрограммирования и длительного культивирования на накопление хромосомных аберраций. Рассмотрены случаи самопроизвольной коррекции кариотипа в ИПСК и возможность исправления крупных хромосомных аномалий с помощью удаления или функционального выключения лишнего гомолога.
Кашеварова А.А., Скрябин Н.А., Никитина Т.В., Лопаткина М.Е., Саженова Е.А., Жигалина Д.И., Савченко Р.Р., Лебедев И.Н. Онтогенетическая плейотропия генов, вовлеченных в CNV у спонтанных абортусов человека. // Генетика, 2019, том 55, № 10, с. 1158–1171.
С помощью микроматричного хромосомного анализа исследованы 52 образца плацентарных тканей спонтанных абортусов человека первого триместра беременности. Выявлены 120 вариаций числа копий участков ДНК (CNV), затрагивающих один или несколько генов (всего 427 генов). С использованием биоинформационного алгоритма анализа обогащения при применении онтологии “Фенотип млекопитающих” все гены были разделены на 183 категории (р ≤ 0.05). Категория “Эмбриогенез” включала 22 гена: AIP, BMP4, BMP5, CDKN1C, EXT1, GAB1, H19, HOXD13, IGF2, KIT, LDHA, NKX2-5, NRK, PEG3, PHLDA2, SMCHD1, SMN1, TBX3, TGIF1, TH, TLX2, TRRAP. Рассмотрены функции каждого из приведенных генов и патологические состояния, ассоциированные с мутациями в них; высказана гипотеза о плейотропном эффекте генов, вовлеченных в CNV у спонтанных абортусов.
просмотров: 2814, опубликовано: 22.08.2019
