доктор биологических наук, заместитель директора Томского НИМЦ по развитию; ведущий научный сотрудник, руководитель лаборатории инструментальной геномики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ.

Контактная информация
Краткая биография
Родился в 1984 г. С отличием окончил в 2007 году магистратуру Биолого-почвенного факультета Томского государственного университета. С 2007 по 2010 год проходил обучение в аспирантуре НИИ медицинской генетики. С 2010 года являлся научным сотрудником лаборатории цитогенетики, а с 2014 года – старшим научным сотрудником. В 2010 году защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности «генетика».

Область научных интересов
Основная область интересов – механизмы возникновения числовых и структурных хромосомных нарушений в соматических клетках человека в зависимости от воздействия внешних и внутренних факторов.
В 2010 г. была защищена кандидатская диссертация по теме «Действие малых доз инкорпорированного плутония-239 на частоту анеуплоидии в соматических клетках человека». В ней было обнаружено влияние плутония-239 в лимфоцитах периферической крови работников радиохимического производства на частоту хромосомного нерасхождения и отставания. Кроме того, был проведен анализ вклада этих механизмов в общую частоту анеуплоидии в соматических клетках человека (Тимошевский и др., 2010). Материалы кандидатской диссертации позволили охарактеризовать анеугенный эффект радиации в качестве нового компонента в оценке генотоксических рисков (Лебедев и др., 2011) и вошли в монографию (Ильинских и др., 2011). В продолжение этой работы индукция анеуплоидии после воздействия ионизирующего излучения была показана и в клетках онкологических больных в ходе лучевой терапии (Мельников и др., 2012; Melnikov et al., 2012).
Основной идеей последующих работ является гипотеза о влиянии эпигенетического фона на спонтанный и индуцированный мутагенез в соматических клетках человека в онтогенезе. В рамках этого направления в качестве важных компонентов эпигенетического фона рассматривается уровень метилирования ретротранспозона LINE-1, составляющего около 20% генома человека, и спонтанный уровень фокусов γH2AX, являющихся основным маркером двунитевых разрывов ДНК в клетках.
Влияние спонтанного уровня фокусов γH2AX на возникновение хромосомных нарушений и жизнеспособность клеток было обнаружено в гемопоэтических стволовых клетках (Vasilyev et al., 2013), опухолевых клеточных линиях (Markova et al., 2015), лимфоцитах периферической крови здоровых индивидов (Васильев и др., 2012; 2015) и онкологических больных (Markova et al., 2015). В настоящее время в лимфоцитах человека проведен полнотранскриптомный анализ и выявлены гены, экспрессия которых связана как со спонтанным уровнем фокусов γH2AX, так и с частотой возникающих хромосомных нарушений после мутагенного воздействия. Таким образом, показано, что спонтанный уровень фокусов γH2AX является важным компонентом эпигенетического фона, определяющим чувствительность клеток и возникновение структурных хромосомных нарушений в ответ на воздействие мутагенов.
Уровень метилирования LINE-1 потенциально может влиять на экспрессию и активность белков этого ретротранспозона, а также активировать инсерционный мутагенез, приводя к возникновению структурных хромосомных нарушений. Кроме того, изменение уровня метилирования LINE-1 в клетках потенциально связано с конформацией центромерных районов хромосом и может приводить к генерации анеуплоидии. Поэтому, нарушение уровня метилирования LINE-1 в отдельных соматических клетках может быть связано с повышением частоты числовых и структурных хромосомных нарушений, а при возникновении в эмбриогенезе – приводить к гибели всего организма. Действительно, нами был обнаружен сниженный уровень метилирования LINE-1 в плацентарных тканях спонтанных абортусов I триместра беременности с нормальным кариотипом по сравнению с нормально развивающимися эмбрионами (Васильев и др. 2015). Гиперметилирование LINE-1 также потенциально может быть связано с нарушениями внутриутробного развития, однако само по себе, по-видимому, не приводит к прерыванию беременности, так как не встречается среди спонтанных абортусов с нормальным кариотипом (Васильев и др., 2015). Тем не менее, гиперметилирование LINE-1 встречается в трофобласте хориона на фоне аномалий кариотипа. Так, повышенный уровень метилирования LINE-1 был обнаружен в трофобласте хориона спонтанных абортусов с мозаичными формами анеуплоидии в отличие от чистых форм (Васильев и др., 2015). Кроме того, в лимфоцитах периферической крови взрослых индивидов была обнаружена связь между гипометилированием LINE-1 и повышением частоты хромосомного отставания.


Достижения, награды, гранты

Web of Science ResearcherID: C-5296-2014

https://publons.com/researcher/1474181/stanislav-vasilyev/

Scopus AuthorID: 56110254200

https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=56110254200

ORCID: 0000-0002-5301-070X

https://orcid.org/0000-0002-5301-070X

РИНЦ AuthorID: 8087-5222

https://elibrary.ru/author_profile.asp?id=205617

 

1. Скрябин Н.А., Васильев С.А., Лебедев И. Н. Эпигенетический сайленсинг структурных вариаций генома // Генетика. 2017. Т. 53, № 10. С. 1132–1140.
2. Васильев С.А., Толмачёва Е.Н., Лебедев И.Н. Эпигенетическая регуляция ретротранспозона LINE-1 и его роль в эмбриогенезе // Генетика. 2016. Т. 52. № 12. С. 1349-1357. 
3. Васильев С.А., Толмачева Е.Н., Кашеварова А.А., Саженова Е.А., Лебедев И.Н. Статус метилирования ретротранспозона LINE-1 при хромосомном мозаицизме на ранних стадиях эмбрионального развития человека // Молекулярная биология. 2015. №1. с. 165-174. 
4. Markova E., Vasilyev S., Belyaev I. 53BP1 foci as a marker of tumor cell radiosensitivity // Neoplasma. 2015. 62(5):770-776. doi: 10.4149/neo_2015_092.
5. Marková E., Somsedíková A., Vasilyev S., Pobijaková M., Lacková A., Lukačko P., Belyaev I. DNA repair foci and late apoptosis/necrosis in peripheral blood lymphocytes of breast cancer patients undergoing radiotherapy // International journal of radiation biology. 2015. Vol.91, №12. P. 934-945.
6. Васильев С.А., Величевская А.И., Вишневская Т.В., Беленко А.А., Грибова О.В., Плаксин М.Б., Старцева Ж.А., Лебедев И.Н. Фоновый уровень фокусов γH2AX в клетках человека как фактор индивидуальной радиочувствительности // Радиационная биология. Радиоэкология. 2015. Т. 55. № 4. С. 402. 
7. Vasilyev S. A., Kubes M., Markova E., Belyaev I. DNA damage response in CD133+ stem/progenitor cells from umbilical cord blood: Low level of endogenous foci and high recruitment of 53BP1 // International journal of radiation biology. 2013. Vol. 89. № 4. P. 301-309.
8. Melnikov A. A., Vasilyev S. A., Musabaeva L. I., Velikaya V. V., Gribova O. V., Startseva Z. A., Urazova L.N., Lebedev I.N., Choynzonov E. L. Cytogenetic effects of neutron therapy in patients with parotid gland tumors and relapse of breast cancer // Experimental oncology. 2012. Vol. 34. № 4. P. 354-357. 
9. Васильев С.А., Тимошевский В.А., Лебедев И.Н. Цитогенетические механизмы генерации анеуплоидии в соматических клетках профессионалов ядерно-химического производства с инкорпорированным плутонием-239 // Генетика. 2010. Т. 46. № 11. С. 1565-1570. 
10. Тимошевский В.А., Лебедев И.Н., Васильев С.А., Суханова Н.Н., Яковлева Ю.С., Торхова Н.Б., Пузырёв В.П. Хромосомный и цитомный анализ соматических клеток работников радиохимического производства с инкорпорированным 239Pu // Радиационная биология. Радиоэкология. 2010. Т. 50. № 6. С. 672-680.