Брагина Елена Юрьевна
кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории популяционной генетики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ

Контактная информация

e-mail: elena.bragina  medgenetics.ru

тел. 8 (3822) 90-11-01 (доп. 1831)

Краткая биография
1989-1995 гг.: Сибирский государственный медицинский университет (Томск), фармацевтический факультет, провизор, специальность «фармация»;
1995-2000 гг.: младший научный сотрудник, группа синтеза и сиквенса нуклеиновых кислот; НИИ медицинской генетики, Томск.
2000-2005 гг.: младший научный сотрудник, лаборатория популяционной генетики; НИИ медицинской генетики, Томск.
2005 г.: кандидат биологических наук, диссертация «Сравнительный анализ структуры наследственной компоненты подверженности к бронхиальной астме и туберкулезу по генам ферментов метаболизма ксенобиотиков» по специальности 03.00.15 - генетика. Руководитель: академик РАМН, профессор Пузырёв Валерий Павлович.

Область научных интересов
Генетика многофакторных заболеваний, генетика коморбидности, феномен сочетанных болезней, гены болезней синтропий/дистропий.

Достижения, награды, гранты

Web of Science ResearcherID: A-8049-2014

https://publons.com/researcher/2568984/elena-eb-bragina/

Scopus AuthorID: 7003857720

https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=7003857720

ORCID: 0000-0002-1103-3073

http://orcid.org/0000-0002-1103-3073

РИНЦ AuthorID: 95164

https://www.elibrary.ru/author_items.asp?authorid=95164

1. Гомбоева Д.Е., Брагина Е.Ю., Назаренко М.С., Пузырев В.П. Обратная коморбидность между онкологическими заболеваниями и болезнью Гентингтона: обзор эпидемиологических и биологических доказательств // Генетика. 2020. Т.56, № 3. С. 260-271. DOI:10.31857/S0016675820030054
2. Zolotareva O., Saik O.V., Königs C., Bragina E.Y., Goncharova I.A., Freidin M.B., Dosenko V.E., Ivanisenko V.A., Hofestädt R. Comorbidity of asthma and hypertension may be mediated by shared genetic dysregulation and drug side effects // Sci Rep. 2019;9(1):16302. doi: 10.1038/s41598-019-52762-w.
3. Bragina E.Yu., Babushkina N.P., Garaeva A.F., Rudko A.A., Tsitrikov D.Yu., Gomboeva D.E., Freidin M.B. Impact of the Polymorphism of the PACRG and CD80 Genes on the Development of the Different Stages of Tuberculosis Infection // Iran J Med Sci. 2019. Volume 44, Issue 3. P. 236-244.
4. Bragina EY, Goncharova IA, Garaeva AF, et al. Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases. J Integr Bioinform. 2018;15(4):20180052. Published 2018 Dec 10. doi:10.1515/jib-2018-0052
5. Shoshi A, Hofestädt R, Zolotareva O, et al. GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks // J Integr Bioinform. 2018;15(4):20180049. doi:10.1515/jib-2018-0049
6. Drevytska T, Morhachov R, Tumanovska L, Portnichenko G, Nagibin V, Boldyriev O, Lapikova-Bryhinska T, Gurianova V, Dons'koi B, Freidin M, Ivanisenko V, Bragina EY, Hofestädt R, Dosenko V. shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma // J Integr Bioinform. 2018;15(4). doi: 10.1515/jib-2018-0053.
7. Saik OV, Demenkov PS, Ivanisenko TV, et al. Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature. J Integr Bioinform. 2018;15(4):20180054. doi:10.1515/jib-2018-0054 
8. Брагин А.О., Соколов В.С., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Брагина Е.Ю., Матушкин Ю.Г., Иванисенко В.А. Программа ALLPRED для предсказания аллергенности бактерий и архей // Молекулярная биология. – 2018 – Том 52. - № 2. – С. 326-332.
9. Saik OV, Demenkov PS, Ivanisenko TV, Bragina EY, Freidin MB, Goncharova IA, Dosenko VE, Zolotareva OI, Hofestaedt R, Lavrik IN, Rogaev EI, Ivanisenko VA. Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks // BMC Medical Genomics. – 2018. - 11 (Suppl 1) :15. https://doi.org/10.1186/s12920-018-0331-4
10. Бабушкина Н.П., Брагина Е.Ю., Гараева А.Ф., Гончарова И.А., Рудко А.А., Цитриков Д.Ю., Гомбоева Д.Е, Фрейдин М.Б. Валидация результатов полногеномных ассоциативных исследований туберкулеза у русских Западной Сибири // Генетика. - 2018. – Том 54. - №1. - С. 109-116.
11. Vonk JM, Scholtens S, Postma DS, Moffatt MF, Jarvis D, Ramasamy A, Wjst M, Omenaas ER, Bouzigon E, Demenais F, Nadif R, Siroux V, Polonikov AV, Solodilova M, Ivanov VP, Curjuric I, Imboden M, Kumar A, Probst-Hensch N, Ogorodova LM, Puzyrev VP, Bragina EY, Freidin MB, Nolte IM, Farrall AM, Cookson WO, Strachan DP, Koppelman GH, Boezen HM. Adult onset asthma and interaction between genes and active tobacco smoking: The GABRIEL consortium. PLoS One. 2017;12(3):e0172716. doi: 10.1371/journal.pone.0172716.
12. Брагина Е.Ю., Фрейдин М.Б., Бабушкина Н.П., Гараева А.Ф., Колоколова О.В., Жалсанова И.Ж., Пузырев В.П. Анализ генов цитокиновой сети в развитии «обратной» коморбидности для бронхиальной астмы и туберкулеза // Медицинская генетика. – 2017. – Том 16. - №1 (175). – С. 20-24.
13. Rudko A.A., Bragina E.Yu., V.P. Puzyrev, Freidin M.B. The genetics of susceptibility to tuberculosis: Progress and challenges // Asian Pacific Journal of Tropical Disease. - 2016. - 6(9). - P. 680-684. doi: 10.1016/S2222-1808(16)61109-X
14. Garaeva A.F., Babushkina N.P., Rudko A.A., Goncharova I.A., Bragina E.Yu., Freidin M.B. Differential genetic background of primary and secondary tuberculosis in Russians // Meta Gene. - 2016.
15. Bragina E.Yu., Tiys E.S., Rudko A.A., Ivanisenko V.A., Freidin M.B. Novel tuberculosis susceptibility candidate genes revealed by the reconstruction and analysis of associative networks // Infection, Genetics and Evolution. – 2016.
16. Брагина Е.Ю., Фрейдин М.Б. Молекулярно-генетические исследования коморбидности // Бюллетень сибирской медицины. - 2015;14(6):94-102. DOI:10.20538/1682-0363-2015-6-94-102.
17. Брагина Е. Ю., Рудко А. А., Тийс Е. С., Иванисенко В. А., Фрейдин М. Б. Новые гены-кандидаты подверженности туберкулезу, установленные с помощью построения и анализа ассоциативных сетей // Бюллетень сибирской медицины. – 2015;14(6):33-35.
18. Rudko A.A., Garaeva A.F., Bragina E.Yu., Babushkina N.P., Kolokolova O.V., Lipaenkova O.N., Freidin M.B., Puzyrev V.P. Mutations in genes underlying atypical familial mycobacteriosis are not found in tuberculosis patients from Siberian populations // Tuberculosis (Edinb). – 2015. - 95(2). – P. 204-207.
19. Bragina E.Yu., Tiys E.S., Freidin M.B., Koneva L.A., Demenkov P.S., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A., Puzyrev V.P. Insights into pathophysiology of dystropy through the analysis of gene networks: an example of bronchial asthma and tuberculosis // Immunogenetics. – 2014. – V. 66(7-8). – P. 457-465. doi: 10.1007/s00251-014-0786-1.
20. Saltykova I.V., Ogorodova L.M., Bragina E.Y., Puzyrev V.P., Freidin M.B. Opisthorchis felineus liver fluke invasion is an environmental factor modifying genetic risk of atopic bronchial asthma. Acta Trop. – 2014. - V. 139. – P. 53-56. doi: 10.1016/j.actatropica.2014.07.004.
21. Scholtens S, Postma DS, Moffatt MF, Panasevich S, Granell R, Henderson AJ, Melén E, Nyberg F, Pershagen G, Jarvis D, Ramasamy A, Wjst M, Svanes C, Bouzigon E, Demenais F, Kauffmann F, Siroux V, von Mutius E, Ege MJ, Braun-Fahrländer C, Genuneit J; GABRIELA study group, Brunekreef B, Smit HA, Wijga AH, Kerkhof M, Curjuric I, Imboden M, Thun GA, Probst-Hensch N, Freidin MB, Bragina EI, Deev IA, Puzyrev VP, Daley D, Park J, Becker A, Chan-Yeung M, Kozyrskyj AL, Pare P, Marenholn I, Lau S, Keil T, Lee YA, Kabesch M, Wijmenga C, Franke L, Nolte IM, Vonk J, Kumar A, Farrall M, Cookson WO, Strachan DP, Koppelman GH, Boezen HM. Novel childhood asthma genes interact with in utero and early-life tobacco smoke exposure. Journal of Allergy and Clinical Immunology. – 2013. – V. 132(6). – P. 27A–28A. doi: 10.1016/j.jaci.2013.08.049. 
22. Фрейдин М.Б., Брагина Е.Ю., Салтыкова И.В., Деева Е.В., Огородова Л.М., Пузырев В.П. Влияние дополнительной болезни (коморбидности) на ассоциацию аллергического ринита с вариантом rs12621643 гена KCNE4 // Генетика. – 2013. – Т. 49. - № 4. - С 541–544.
23. Салтыкова И.В., Фрейдин М.Б., Брагина Е.Ю., Огородова Л.М., Пузырев В.П. Ассоциация полиморфизма rs6737848 гена SOCS5 с бронхиальной астмой // Вестник РАМН. - 2013. - № 7. - С. 53–56.
24. Брагина Е.Ю., Рудко А.А., Фрейдин М.Б., Салтыкова И.В., Ан А.Р., Гараева А.Ф., Конева Л.А., Мингареева К.В., Воробьева Н.А., Огородова Л.М., Пузырев В.П. Ассоциация полиморфизма генов Th1/Th2 поляризации иммунного ответа с иммунологически «полярными» заболеваниями (бронхиальная астма и туберкулез) // Медицинская генетика. – 2013. – № 11. – С. 40-43.
25. Фрейдин М.Б., Брагина Е.Ю., Федорова О.С., Деев И.А., Куликов Е.С., Огородова Л.М., Пузырев В.П. Полногеномный анализ ассоциаций аллергических заболеваний с молекулярными маркерами у русских жителей Западной Сибири // Молекулярная биология. – 2011. – Т. 45, № 3. - С. 464–472. 
26. Moffatt M.F., Gut I.G., Demenais F. et GABRIEL consortium A large-scale, consortium-based genomewide association study of asthma // N Engl J Med. – 2010. – V. 363. – P. 1211-1221.